SMA Negeri 3 Kendari menyediakan kelas tambahan sore untuk membantu siswa memahami materi pelajaran secara mendalam. Kegiatan ini mencakup pembinaan olimpiade mata pelajaran dan persiapan menghadapi ujian sekolah.
Melalui gerakan literasi sekolah, siswa didorong untuk gemar membaca setiap pagi, memanfaatkan perpustakaan mini di kelas, serta mengikuti lomba menulis dan membaca cerita anak atau pantun daerah.
Beragam kegiatan ekstrakurikuler ditawarkan seperti Pramuka, tari tradisional, seni gambar, dan olahraga ringan, guna menumbuhkan bakat dan minat siswa dalam bidang seni dan fisik sejak dini.
SMA Negeri 3 Kendari aktif menjalankan program Jumat Bersih, menanam tanaman hias di halaman sekolah, memilah sampah organik dan anorganik, serta menciptakan sudut hijau sebagai bagian dari pembelajaran lingkungan hidup.
SMA Negeri 3 Kendari aktif membangun budaya literasi melalui program membaca pagi, sudut baca di setiap kelas, serta kegiatan keagamaan seperti pembinaan rohani untuk membentuk karakter siswa yang religius dan berbudi pekerti luhur.
Pembelajaran di SMA Negeri 3 Kendari dilakukan secara aktif dan inovatif. Siswa diajak untuk berpartisipasi dalam diskusi kelompok, proyek tematik, penggunaan media pembelajaran berbasis teknologi.
Sekolah ini menawarkan beragam kegiatan ekstrakurikuler untuk mengembangkan bakat dan karakter siswa, seperti Pramuka, Paskibra, futsal, seni tari tradisional Papua